Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN2BP42772 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2BP42772 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms