Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC19A1P41440 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms