Protein–RNA interactions for Protein: P40479

SDP1, Dual-specificity protein phosphatase SDP1, yeastyeast

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SDP1P40479 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6□□□□□ -1.45
SDP1P40479 SUF5tG(CCC)O 72 nt6□□□□□ -1.45
SDP1P40479 HYM1YKL189W 1200 nt6□□□□□ -1.45
SDP1P40479 MIA40YKL195W 1212 nt6□□□□□ -1.45
SDP1P40479 SWD1YAR003W 1281 nt6□□□□□ -1.45
SDP1P40479 CSI1YMR025W 888 nt6□□□□□ -1.45
SDP1P40479 YOL166CYOL166C 339 nt6□□□□□ -1.45
SDP1P40479 SCP1YOR367W 603 nt6□□□□□ -1.45
SDP1P40479 FIT2YOR382W 462 nt6□□□□□ -1.45
SDP1P40479 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt6□□□□□ -1.45
SDP1P40479 ADH5YBR145W 1056 nt6□□□□□ -1.45
SDP1P40479 PPM2YOL141W 2088 nt6□□□□□ -1.45
SDP1P40479 YFR006WYFR006W 1608 nt5.99□□□□□ -1.45
SDP1P40479 STT3YGL022W 2157 nt5.99□□□□□ -1.45
SDP1P40479 YPK3YBR028C 1578 nt5.99□□□□□ -1.45
SDP1P40479 RMD1YDL001W 1293 nt5.99□□□□□ -1.45
SDP1P40479 YDL121CYDL121C 450 nt5.99□□□□□ -1.45
SDP1P40479 SHR3YDL212W 633 nt5.99□□□□□ -1.45
SDP1P40479 HVG1YER039C 750 nt5.99□□□□□ -1.45
SDP1P40479 YJR084WYJR084W 1272 nt5.99□□□□□ -1.45
SDP1P40479 SRY1YKL218C 981 nt5.99□□□□□ -1.45
SDP1P40479 SPC34YKR037C 888 nt5.99□□□□□ -1.45
SDP1P40479 YLL056CYLL056C 897 nt5.99□□□□□ -1.45
SDP1P40479 YML090WYML090W 387 nt5.99□□□□□ -1.45
SDP1P40479 ERG29YMR134W 714 nt5.99□□□□□ -1.45
SDP1P40479 YNL134CYNL134C 1131 nt5.99□□□□□ -1.45
SDP1P40479 SKY1YMR216C 2229 nt5.99□□□□□ -1.45
SDP1P40479 VPS36YLR417W 1701 nt5.99□□□□□ -1.45
SDP1P40479 YJL163CYJL163C 1668 nt5.98□□□□□ -1.45
SDP1P40479 UPS3YDR185C 540 nt5.98□□□□□ -1.45
SDP1P40479 YDR249CYDR249C 1122 nt5.98□□□□□ -1.45
SDP1P40479 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.98□□□□□ -1.45
SDP1P40479 RPF2YKR081C 1035 nt5.98□□□□□ -1.45
SDP1P40479 RCE1YMR274C 948 nt5.98□□□□□ -1.45
SDP1P40479 MRPL19YNL185C 477 nt5.98□□□□□ -1.45
SDP1P40479 PTC4YBR125C 1182 nt5.98□□□□□ -1.45
SDP1P40479 MSC3YLR219W 2187 nt5.98□□□□□ -1.45
SDP1P40479 NUP49YGL172W 1419 nt5.98□□□□□ -1.45
SDP1P40479 RRP14YKL082C 1305 nt5.98□□□□□ -1.45
SDP1P40479 NUR1YDL089W 1455 nt5.97□□□□□ -1.45
SDP1P40479 MFG1YDL233W 1377 nt5.97□□□□□ -1.45
SDP1P40479 HEM1YDR232W 1647 nt5.97□□□□□ -1.45
SDP1P40479 CLN1YMR199W 1641 nt5.97□□□□□ -1.45
SDP1P40479 YPT1YFL038C 621 nt5.97□□□□□ -1.45
SDP1P40479 QCR6YFR033C 444 nt5.97□□□□□ -1.45
SDP1P40479 YGR168CYGR168C 1131 nt5.97□□□□□ -1.45
SDP1P40479 RFC4YOL094C 972 nt5.97□□□□□ -1.45
SDP1P40479 SEC62YPL094C 825 nt5.97□□□□□ -1.45
SDP1P40479 SUT2YPR009W 807 nt5.97□□□□□ -1.45
SDP1P40479 JIP4YDR475C 2631 nt5.97□□□□□ -1.45
SDP1P40479 LAT1YNL071W 1449 nt5.97□□□□□ -1.45
SDP1P40479 COQ1YBR003W 1422 nt5.97□□□□□ -1.45
SDP1P40479 ATF1YOR377W 1578 nt5.97□□□□□ -1.45
SDP1P40479 EMP65YER140W 1671 nt5.96□□□□□ -1.46
SDP1P40479 PIB1YDR313C 861 nt5.96□□□□□ -1.46
SDP1P40479 YHR112CYHR112C 1137 nt5.96□□□□□ -1.46
SDP1P40479 NVJ1YHR195W 966 nt5.96□□□□□ -1.46
SDP1P40479 ATG36YJL185C 882 nt5.96□□□□□ -1.46
SDP1P40479 SML1YML058W 315 nt5.96□□□□□ -1.46
SDP1P40479 SEC65YML105C 822 nt5.96□□□□□ -1.46
SDP1P40479 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt5.96□□□□□ -1.46
SDP1P40479 SPO20YMR017W 1194 nt5.96□□□□□ -1.46
SDP1P40479 COX5AYNL052W 462 nt5.96□□□□□ -1.46
SDP1P40479 EFM2YBR271W 1260 nt5.96□□□□□ -1.46
SDP1P40479 YJR124CYJR124C 1347 nt5.96□□□□□ -1.46
SDP1P40479 ECM7YLR443W 1347 nt5.96□□□□□ -1.46
SDP1P40479 HED1YDR014W-A 489 nt5.95□□□□□ -1.46
SDP1P40479 PFA5YDR459C 1125 nt5.95□□□□□ -1.46
SDP1P40479 SPO74YGL170C 1242 nt5.95□□□□□ -1.46
SDP1P40479 MND2YIR025W 1107 nt5.95□□□□□ -1.46
SDP1P40479 YLR366WYLR366W 306 nt5.95□□□□□ -1.46
SDP1P40479 EDE1YBL047C 4146 nt5.95□□□□□ -1.46
SDP1P40479 YBL070CYBL070C 321 nt5.95□□□□□ -1.46
SDP1P40479 RPN8YOR261C 1017 nt5.95□□□□□ -1.46
SDP1P40479 MRL1YPR079W 1146 nt5.95□□□□□ -1.46
SDP1P40479 RSC2YLR357W 2670 nt5.94□□□□□ -1.46
SDP1P40479 PRE3YJL001W 648 nt5.94□□□□□ -1.46
SDP1P40479 YOX1YML027W 1158 nt5.94□□□□□ -1.46
SDP1P40479 NOP13YNL175C 1212 nt5.94□□□□□ -1.46
SDP1P40479 PEX32YBR168W 1242 nt5.94□□□□□ -1.46
SDP1P40479 SES1YDR023W 1389 nt5.93□□□□□ -1.46
SDP1P40479 COX10YPL172C 1389 nt5.93□□□□□ -1.46
SDP1P40479 YGR273CYGR273C 525 nt5.93□□□□□ -1.46
SDP1P40479 YHL044WYHL044W 708 nt5.93□□□□□ -1.46
SDP1P40479 PPE1YHR075C 1203 nt5.93□□□□□ -1.46
SDP1P40479 SUI2YJR007W 915 nt5.93□□□□□ -1.46
SDP1P40479 ECM9YKR004C 1134 nt5.93□□□□□ -1.46
SDP1P40479 OSW5YMR148W 447 nt5.93□□□□□ -1.46
SDP1P40479 YPR076WYPR076W 375 nt5.93□□□□□ -1.46
SDP1P40479 MET16YPR167C 786 nt5.93□□□□□ -1.46
SDP1P40479 DOT1YDR440W 1749 nt5.93□□□□□ -1.46
SDP1P40479 GLN3YER040W 2193 nt5.93□□□□□ -1.46
SDP1P40479 PHO3YBR092C 1404 nt5.92□□□□□ -1.46
SDP1P40479 YDL023CYDL023C 321 nt5.92□□□□□ -1.46
SDP1P40479 YDR124WYDR124W 975 nt5.92□□□□□ -1.46
SDP1P40479 AIM23YJL131C 1071 nt5.92□□□□□ -1.46
SDP1P40479 YJL171CYJL171C 1191 nt5.92□□□□□ -1.46
SDP1P40479 FBA1YKL060C 1080 nt5.92□□□□□ -1.46
SDP1P40479 RPR1RPR1 369 nt5.92□□□□□ -1.46
SDP1P40479 YOL046CYOL046C 675 nt5.92□□□□□ -1.46
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