Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VHLP40337 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VHLP40337 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VHLP40337 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VHLP40337 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VHLP40337 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VHLP40337 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VHLP40337 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VHLP40337 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VHLP40337 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VHLP40337 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VHLP40337 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VHLP40337 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VHLP40337 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VHLP40337 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VHLP40337 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VHLP40337 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VHLP40337 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VHLP40337 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VHLP40337 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VHLP40337 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VHLP40337 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VHLP40337 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VHLP40337 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VHLP40337 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VHLP40337 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VHLP40337 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VHLP40337 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VHLP40337 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VHLP40337 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VHLP40337 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VHLP40337 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VHLP40337 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VHLP40337 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VHLP40337 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VHLP40337 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VHLP40337 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VHLP40337 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VHLP40337 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VHLP40337 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VHLP40337 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VHLP40337 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VHLP40337 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VHLP40337 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VHLP40337 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VHLP40337 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VHLP40337 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VHLP40337 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VHLP40337 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VHLP40337 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VHLP40337 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VHLP40337 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VHLP40337 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VHLP40337 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VHLP40337 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VHLP40337 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VHLP40337 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VHLP40337 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VHLP40337 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VHLP40337 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VHLP40337 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VHLP40337 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VHLP40337 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VHLP40337 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VHLP40337 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VHLP40337 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VHLP40337 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VHLP40337 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VHLP40337 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VHLP40337 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VHLP40337 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VHLP40337 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VHLP40337 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VHLP40337 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VHLP40337 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VHLP40337 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VHLP40337 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VHLP40337 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VHLP40337 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VHLP40337 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VHLP40337 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VHLP40337 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VHLP40337 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VHLP40337 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VHLP40337 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VHLP40337 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VHLP40337 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VHLP40337 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VHLP40337 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VHLP40337 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VHLP40337 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VHLP40337 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VHLP40337 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VHLP40337 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VHLP40337 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VHLP40337 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VHLP40337 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VHLP40337 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VHLP40337 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VHLP40337 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms