Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EIF4A3P38919 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EIF4A3P38919 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms