Protein–RNA interactions for Protein: P35995

YKL222C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YKL222C, yeastyeast

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL222CP35995 MEU1YLR017W 1014 nt7.11□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 NEJ1YLR265C 1029 nt7.11□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 LST8YNL006W 912 nt7.11□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 TOS6YNL300W 309 nt7.11□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 MRI1YPR118W 1236 nt7.11□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 ARR3YPR201W 1215 nt7.11□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 AME1YBR211C 975 nt7.11□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 MSS116YDR194C 1995 nt7.11□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 RAD24YER173W 1980 nt7.11□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 YJR015WYJR015W 1533 nt7.11□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 CCC2YDR270W 3015 nt7.11□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 APM1YPL259C 1428 nt7.1□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 NUF2YOL069W 1356 nt7.1□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 YDL023CYDL023C 321 nt7.1□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 YDL158CYDL158C 309 nt7.1□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 AIM2YAL049C 741 nt7.1□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt7.1□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 YBL070CYBL070C 321 nt7.1□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 MIP1YOR330C 3765 nt7.1□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 YLR194CYLR194C 765 nt7.09□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 KTR1YOR099W 1182 nt7.09□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 DAL4YIR028W 1908 nt7.09□□□□□ -1.27
YKL222CP35995 BDF2YDL070W 1917 nt7.08□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 ECM9YKR004C 1134 nt7.08□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 IRC14YOR135C 342 nt7.08□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 PRM4YPL156C 855 nt7.08□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 TFB4YPR056W 1017 nt7.08□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 GYP8YFL027C 1494 nt7.08□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 MCH2YKL221W 1422 nt7.08□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 YMR027WYMR027W 1413 nt7.08□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 SGE1YPR198W 1632 nt7.08□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 KNS1YLL019C 2214 nt7.08□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 NUP84YDL116W 2181 nt7.08□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 GPB2YAL056W 2643 nt7.07□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 SKY1YMR216C 2229 nt7.07□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 SOG2YOR353C 2376 nt7.07□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 YHR054CYHR054C 1065 nt7.07□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt7.07□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 YMR147WYMR147W 672 nt7.07□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 ARC35YNR035C 1029 nt7.07□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 YOL107WYOL107W 1029 nt7.07□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 GLN1YPR035W 1113 nt7.07□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 SLX1YBR228W 915 nt7.07□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 HMS2YJR147W 1077 nt7.06□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 YPR114WYPR114W 948 nt7.06□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 VPS72YDR485C 2388 nt7.06□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 WHI2YOR043W 1461 nt7.05□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 SLA2YNL243W 2907 nt7.05□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 YGR182CYGR182C 354 nt7.05□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 REV7YIL139C 738 nt7.05□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 YKR032WYKR032W 315 nt7.05□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 YLR118CYLR118C 684 nt7.05□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 VID30YGL227W 2877 nt7.04□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 RQC1YDR333C 2172 nt7.04□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 PGU1YJR153W 1086 nt7.04□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 MSA2YKR077W 1092 nt7.04□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 HCR1YLR192C 798 nt7.04□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 RKI1YOR095C 777 nt7.04□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 SCO2YBR024W 906 nt7.04□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 YBR144CYBR144C 315 nt7.04□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 HAS1YMR290C 1518 nt7.03□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 TAF4YMR005W 1167 nt7.03□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 HRQ1YDR291W 3234 nt7.03□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 PEX31YGR004W 1389 nt7.03□□□□□ -1.28
YKL222CP35995 TIM54YJL054W 1437 nt7.02□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt7.02□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 YJR107WYJR107W 987 nt7.02□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 YKL151CYKL151C 1014 nt7.02□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 CSI1YMR025W 888 nt7.02□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 YNL296WYNL296W 315 nt7.02□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 RSP5YER125W 2430 nt7.02□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 COT1YOR316C 1320 nt7.01□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 YCK1YHR135C 1617 nt7.01□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 BPL1YDL141W 2073 nt7.01□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 QCR8YJL166W 285 nt7.01□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 OSW1YOR255W 837 nt7.01□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 YPL062WYPL062W 405 nt7.01□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 SUT2YPR009W 807 nt7.01□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 TAH11YJR046W 1815 nt7.01□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 VMA2YBR127C 1554 nt7□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 MHR1YDR296W 681 nt7□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 RRP4YHR069C 1080 nt7□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 YHR140WYHR140W 720 nt7□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 JJJ3YJR097W 519 nt7□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 DAL82YNL314W 768 nt7□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 YOR012WYOR012W 414 nt7□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 APM4YOL062C 1476 nt6.99□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 NUD1YOR373W 2556 nt6.99□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 CCT3YJL014W 1605 nt6.99□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 ATG7YHR171W 1893 nt6.99□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 BCY1YIL033C 1251 nt6.99□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 TIF34YMR146C 1044 nt6.99□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 IES2YNL215W 963 nt6.99□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 YNL303WYNL303W 348 nt6.99□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 MCT1YOR221C 1083 nt6.99□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 CLN1YMR199W 1641 nt6.98□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 YCL065WYCL065W 369 nt6.98□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 COX9YDL067C 180 nt6.98□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 YDR154CYDR154C 351 nt6.98□□□□□ -1.29
YKL222CP35995 COX16YJL003W 357 nt6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29 ms