Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPA3P35244 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPA3P35244 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPA3P35244 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPA3P35244 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPA3P35244 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPA3P35244 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPA3P35244 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPA3P35244 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPA3P35244 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPA3P35244 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPA3P35244 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPA3P35244 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPA3P35244 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPA3P35244 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPA3P35244 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPA3P35244 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPA3P35244 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPA3P35244 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPA3P35244 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPA3P35244 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPA3P35244 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPA3P35244 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPA3P35244 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPA3P35244 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPA3P35244 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPA3P35244 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPA3P35244 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPA3P35244 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPA3P35244 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPA3P35244 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPA3P35244 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPA3P35244 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPA3P35244 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPA3P35244 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RPA3P35244 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPA3P35244 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPA3P35244 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPA3P35244 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPA3P35244 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPA3P35244 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPA3P35244 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPA3P35244 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPA3P35244 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPA3P35244 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPA3P35244 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPA3P35244 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPA3P35244 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPA3P35244 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPA3P35244 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPA3P35244 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPA3P35244 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPA3P35244 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPA3P35244 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPA3P35244 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPA3P35244 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPA3P35244 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPA3P35244 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPA3P35244 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPA3P35244 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPA3P35244 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPA3P35244 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPA3P35244 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPA3P35244 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RPA3P35244 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPA3P35244 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPA3P35244 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPA3P35244 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPA3P35244 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPA3P35244 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPA3P35244 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RPA3P35244 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPA3P35244 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPA3P35244 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPA3P35244 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPA3P35244 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPA3P35244 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPA3P35244 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPA3P35244 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPA3P35244 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPA3P35244 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPA3P35244 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPA3P35244 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPA3P35244 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPA3P35244 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPA3P35244 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPA3P35244 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPA3P35244 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPA3P35244 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPA3P35244 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPA3P35244 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPA3P35244 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPA3P35244 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPA3P35244 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPA3P35244 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPA3P35244 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPA3P35244 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPA3P35244 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPA3P35244 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RPA3P35244 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms