Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN7P35236 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms