Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD11P31277 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms