Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa2P31245 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms