Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnnd1P30999 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnnd1P30999 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms