Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECHS1P30084 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms