Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sept4P28661 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sept4P28661 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sept4P28661 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sept4P28661 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sept4P28661 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sept4P28661 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sept4P28661 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sept4P28661 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sept4P28661 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept4P28661 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept4P28661 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept4P28661 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sept4P28661 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sept4P28661 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sept4P28661 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sept4P28661 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sept4P28661 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sept4P28661 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms