Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SSFA2P28290 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SSFA2P28290 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SSFA2P28290 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms