Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna1P26231 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna1P26231 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna1P26231 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna1P26231 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna1P26231 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna1P26231 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna1P26231 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna1P26231 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna1P26231 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna1P26231 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna1P26231 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna1P26231 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna1P26231 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna1P26231 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna1P26231 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna1P26231 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctnna1P26231 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnna1P26231 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms