Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO2P25791 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO2P25791 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO2P25791 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO2P25791 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO2P25791 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO2P25791 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO2P25791 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO2P25791 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO2P25791 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO2P25791 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO2P25791 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO2P25791 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO2P25791 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO2P25791 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO2P25791 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO2P25791 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO2P25791 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO2P25791 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO2P25791 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO2P25791 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO2P25791 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO2P25791 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO2P25791 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO2P25791 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO2P25791 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO2P25791 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO2P25791 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO2P25791 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO2P25791 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO2P25791 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO2P25791 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO2P25791 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO2P25791 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO2P25791 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO2P25791 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO2P25791 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO2P25791 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO2P25791 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO2P25791 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO2P25791 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO2P25791 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO2P25791 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO2P25791 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO2P25791 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO2P25791 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO2P25791 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO2P25791 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO2P25791 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO2P25791 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO2P25791 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO2P25791 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO2P25791 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO2P25791 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO2P25791 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO2P25791 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO2P25791 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO2P25791 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO2P25791 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO2P25791 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO2P25791 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO2P25791 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO2P25791 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO2P25791 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO2P25791 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO2P25791 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO2P25791 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO2P25791 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO2P25791 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO2P25791 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO2P25791 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO2P25791 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO2P25791 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO2P25791 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO2P25791 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO2P25791 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO2P25791 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO2P25791 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO2P25791 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO2P25791 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO2P25791 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO2P25791 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO2P25791 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO2P25791 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO2P25791 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO2P25791 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO2P25791 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO2P25791 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO2P25791 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO2P25791 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO2P25791 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO2P25791 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO2P25791 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO2P25791 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO2P25791 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO2P25791 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO2P25791 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO2P25791 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO2P25791 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO2P25791 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms