Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria1P23818 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria1P23818 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gria1P23818 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gria1P23818 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria1P23818 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria1P23818 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gria1P23818 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gria1P23818 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria1P23818 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms