Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Xrcc6P23475 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrcc6P23475 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms