Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PparaP23204 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PparaP23204 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PparaP23204 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PparaP23204 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PparaP23204 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PparaP23204 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PparaP23204 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PparaP23204 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PparaP23204 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PparaP23204 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PparaP23204 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PparaP23204 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PparaP23204 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PparaP23204 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PparaP23204 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PparaP23204 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PparaP23204 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PparaP23204 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PparaP23204 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PparaP23204 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PparaP23204 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PparaP23204 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PparaP23204 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PparaP23204 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PparaP23204 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PparaP23204 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PparaP23204 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PparaP23204 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PparaP23204 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PparaP23204 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PparaP23204 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PparaP23204 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PparaP23204 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PparaP23204 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PparaP23204 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PparaP23204 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PparaP23204 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PparaP23204 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PparaP23204 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PparaP23204 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PparaP23204 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PparaP23204 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PparaP23204 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PparaP23204 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PparaP23204 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PparaP23204 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PparaP23204 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PparaP23204 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PparaP23204 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PparaP23204 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PparaP23204 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PparaP23204 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PparaP23204 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PparaP23204 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PparaP23204 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PparaP23204 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PparaP23204 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PparaP23204 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PparaP23204 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PparaP23204 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PparaP23204 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PparaP23204 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PparaP23204 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PparaP23204 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PparaP23204 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PparaP23204 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PparaP23204 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PparaP23204 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PparaP23204 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PparaP23204 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PparaP23204 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PparaP23204 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PparaP23204 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PparaP23204 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PparaP23204 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PparaP23204 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PparaP23204 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PparaP23204 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PparaP23204 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PparaP23204 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PparaP23204 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PparaP23204 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PparaP23204 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PparaP23204 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PparaP23204 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PparaP23204 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PparaP23204 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PparaP23204 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PparaP23204 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PparaP23204 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PparaP23204 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PparaP23204 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PparaP23204 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PparaP23204 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PparaP23204 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PparaP23204 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PparaP23204 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PparaP23204 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PparaP23204 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms