Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPAP23025 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPAP23025 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPAP23025 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
XPAP23025 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPAP23025 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPAP23025 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPAP23025 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPAP23025 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPAP23025 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPAP23025 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPAP23025 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPAP23025 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPAP23025 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPAP23025 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPAP23025 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPAP23025 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPAP23025 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPAP23025 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPAP23025 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPAP23025 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPAP23025 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPAP23025 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPAP23025 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPAP23025 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPAP23025 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPAP23025 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPAP23025 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPAP23025 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPAP23025 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPAP23025 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPAP23025 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
XPAP23025 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPAP23025 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XPAP23025 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
XPAP23025 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPAP23025 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPAP23025 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPAP23025 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPAP23025 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPAP23025 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPAP23025 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPAP23025 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
XPAP23025 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPAP23025 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPAP23025 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPAP23025 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPAP23025 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPAP23025 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPAP23025 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPAP23025 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPAP23025 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
XPAP23025 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
XPAP23025 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPAP23025 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPAP23025 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPAP23025 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPAP23025 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPAP23025 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
XPAP23025 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPAP23025 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
XPAP23025 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPAP23025 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPAP23025 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPAP23025 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPAP23025 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPAP23025 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPAP23025 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPAP23025 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPAP23025 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPAP23025 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPAP23025 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPAP23025 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPAP23025 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPAP23025 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPAP23025 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
XPAP23025 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPAP23025 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPAP23025 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPAP23025 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPAP23025 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPAP23025 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPAP23025 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPAP23025 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPAP23025 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPAP23025 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPAP23025 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
XPAP23025 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPAP23025 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPAP23025 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPAP23025 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPAP23025 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPAP23025 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPAP23025 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPAP23025 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
XPAP23025 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPAP23025 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPAP23025 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPAP23025 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
XPAP23025 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms