Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P22392 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P22392 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P22392 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P22392 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P22392 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P22392 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P22392 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P22392 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P22392 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P22392 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME2P22392 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME2P22392 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME2P22392 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME2P22392 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME2P22392 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME2P22392 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME2P22392 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME2P22392 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NME2P22392 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME2P22392 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME2P22392 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME2P22392 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME2P22392 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME2P22392 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME2P22392 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME2P22392 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME2P22392 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME2P22392 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NME2P22392 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME2P22392 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME2P22392 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME2P22392 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME2P22392 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME2P22392 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME2P22392 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME2P22392 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME2P22392 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME2P22392 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME2P22392 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME2P22392 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME2P22392 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME2P22392 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME2P22392 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME2P22392 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME2P22392 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NME2P22392 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME2P22392 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME2P22392 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME2P22392 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME2P22392 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME2P22392 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME2P22392 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME2P22392 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME2P22392 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME2P22392 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME2P22392 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME2P22392 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME2P22392 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME2P22392 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME2P22392 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME2P22392 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME2P22392 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NME2P22392 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME2P22392 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME2P22392 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME2P22392 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME2P22392 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME2P22392 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME2P22392 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NME2P22392 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME2P22392 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME2P22392 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME2P22392 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME2P22392 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME2P22392 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME2P22392 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME2P22392 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME2P22392 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NME2P22392 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NME2P22392 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME2P22392 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME2P22392 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME2P22392 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME2P22392 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME2P22392 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME2P22392 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME2P22392 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME2P22392 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME2P22392 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME2P22392 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME2P22392 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME2P22392 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NME2P22392 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME2P22392 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME2P22392 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME2P22392 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME2P22392 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME2P22392 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME2P22392 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms