Protein–RNA interactions for Protein: P22227

Zfp42, Zinc finger protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp42P22227 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp42P22227 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp42P22227 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms