Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lsp1P19973 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lsp1P19973 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lsp1P19973 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.2 ms