Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13aP19253 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13aP19253 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl13aP19253 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl13aP19253 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl13aP19253 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl13aP19253 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl13aP19253 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl13aP19253 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13aP19253 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms