Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phka1P18826 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phka1P18826 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Phka1P18826 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phka1P18826 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phka1P18826 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phka1P18826 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Phka1P18826 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phka1P18826 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phka1P18826 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phka1P18826 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phka1P18826 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms