Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGAM1P18669 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms