Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFEP18615 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFEP18615 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFEP18615 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFEP18615 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFEP18615 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFEP18615 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFEP18615 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFEP18615 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFEP18615 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFEP18615 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFEP18615 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFEP18615 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFEP18615 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFEP18615 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFEP18615 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFEP18615 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFEP18615 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFEP18615 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFEP18615 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFEP18615 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFEP18615 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFEP18615 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFEP18615 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFEP18615 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFEP18615 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFEP18615 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFEP18615 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFEP18615 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFEP18615 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFEP18615 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFEP18615 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFEP18615 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFEP18615 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFEP18615 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFEP18615 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFEP18615 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFEP18615 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFEP18615 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFEP18615 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFEP18615 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFEP18615 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFEP18615 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFEP18615 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFEP18615 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFEP18615 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFEP18615 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFEP18615 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFEP18615 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFEP18615 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFEP18615 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFEP18615 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFEP18615 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFEP18615 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFEP18615 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFEP18615 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFEP18615 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFEP18615 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFEP18615 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFEP18615 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFEP18615 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFEP18615 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFEP18615 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFEP18615 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFEP18615 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFEP18615 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFEP18615 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFEP18615 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFEP18615 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFEP18615 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFEP18615 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFEP18615 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFEP18615 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFEP18615 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFEP18615 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFEP18615 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFEP18615 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFEP18615 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFEP18615 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFEP18615 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFEP18615 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFEP18615 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFEP18615 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFEP18615 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFEP18615 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFEP18615 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFEP18615 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFEP18615 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFEP18615 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFEP18615 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFEP18615 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFEP18615 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFEP18615 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFEP18615 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFEP18615 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFEP18615 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFEP18615 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFEP18615 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFEP18615 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFEP18615 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms