Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPI1P17947 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPI1P17947 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPI1P17947 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPI1P17947 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPI1P17947 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPI1P17947 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPI1P17947 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPI1P17947 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPI1P17947 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPI1P17947 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPI1P17947 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPI1P17947 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPI1P17947 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPI1P17947 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SPI1P17947 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPI1P17947 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPI1P17947 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPI1P17947 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPI1P17947 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPI1P17947 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPI1P17947 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPI1P17947 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPI1P17947 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPI1P17947 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPI1P17947 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPI1P17947 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPI1P17947 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPI1P17947 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPI1P17947 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPI1P17947 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPI1P17947 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPI1P17947 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPI1P17947 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPI1P17947 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPI1P17947 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPI1P17947 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPI1P17947 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPI1P17947 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPI1P17947 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPI1P17947 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPI1P17947 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPI1P17947 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPI1P17947 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPI1P17947 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPI1P17947 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPI1P17947 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPI1P17947 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPI1P17947 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPI1P17947 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPI1P17947 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPI1P17947 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPI1P17947 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPI1P17947 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPI1P17947 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPI1P17947 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPI1P17947 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPI1P17947 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPI1P17947 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPI1P17947 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPI1P17947 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPI1P17947 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPI1P17947 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPI1P17947 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPI1P17947 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPI1P17947 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPI1P17947 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPI1P17947 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPI1P17947 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPI1P17947 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPI1P17947 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPI1P17947 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPI1P17947 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPI1P17947 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPI1P17947 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPI1P17947 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPI1P17947 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPI1P17947 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPI1P17947 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPI1P17947 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPI1P17947 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPI1P17947 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPI1P17947 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPI1P17947 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPI1P17947 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPI1P17947 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPI1P17947 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPI1P17947 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPI1P17947 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPI1P17947 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPI1P17947 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPI1P17947 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPI1P17947 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPI1P17947 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPI1P17947 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPI1P17947 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPI1P17947 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPI1P17947 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPI1P17947 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPI1P17947 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms