Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB8P17481 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms