Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sptan1P16546 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms