Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LdhbP16125 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LdhbP16125 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LdhbP16125 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LdhbP16125 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LdhbP16125 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LdhbP16125 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LdhbP16125 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LdhbP16125 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LdhbP16125 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LdhbP16125 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LdhbP16125 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LdhbP16125 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LdhbP16125 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms