Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSF2RAP15509 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF2RAP15509 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF2RAP15509 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms