Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPA1P15085 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPA1P15085 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPA1P15085 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPA1P15085 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPA1P15085 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPA1P15085 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPA1P15085 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA1P15085 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA1P15085 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA1P15085 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA1P15085 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA1P15085 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA1P15085 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA1P15085 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA1P15085 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA1P15085 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA1P15085 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPA1P15085 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPA1P15085 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPA1P15085 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPA1P15085 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CPA1P15085 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPA1P15085 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPA1P15085 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CPA1P15085 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPA1P15085 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPA1P15085 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPA1P15085 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPA1P15085 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPA1P15085 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPA1P15085 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPA1P15085 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPA1P15085 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CPA1P15085 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPA1P15085 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPA1P15085 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPA1P15085 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPA1P15085 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CPA1P15085 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPA1P15085 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPA1P15085 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CPA1P15085 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPA1P15085 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPA1P15085 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPA1P15085 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPA1P15085 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPA1P15085 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPA1P15085 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPA1P15085 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPA1P15085 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPA1P15085 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPA1P15085 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPA1P15085 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPA1P15085 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPA1P15085 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPA1P15085 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPA1P15085 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPA1P15085 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPA1P15085 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPA1P15085 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CPA1P15085 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPA1P15085 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPA1P15085 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPA1P15085 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPA1P15085 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPA1P15085 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPA1P15085 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPA1P15085 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPA1P15085 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPA1P15085 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPA1P15085 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPA1P15085 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPA1P15085 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPA1P15085 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPA1P15085 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CPA1P15085 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPA1P15085 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPA1P15085 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPA1P15085 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPA1P15085 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPA1P15085 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPA1P15085 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPA1P15085 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPA1P15085 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPA1P15085 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPA1P15085 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPA1P15085 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPA1P15085 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPA1P15085 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPA1P15085 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPA1P15085 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPA1P15085 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPA1P15085 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPA1P15085 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPA1P15085 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPA1P15085 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPA1P15085 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPA1P15085 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPA1P15085 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms