Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-Q9P14431 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-Q9P14431 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-Q9P14431 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-Q9P14431 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-Q9P14431 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-Q9P14431 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-Q9P14431 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-Q9P14431 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-Q9P14431 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-Q9P14431 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-Q9P14431 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-Q9P14431 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-Q9P14431 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-Q9P14431 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-Q9P14431 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-Q9P14431 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-Q9P14431 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms