Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MTHFD2P13995 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFD2P13995 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.5 ms