Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SCG2P13521 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCG2P13521 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCG2P13521 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCG2P13521 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCG2P13521 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCG2P13521 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCG2P13521 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCG2P13521 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCG2P13521 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCG2P13521 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCG2P13521 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCG2P13521 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCG2P13521 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCG2P13521 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCG2P13521 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCG2P13521 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCG2P13521 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCG2P13521 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCG2P13521 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCG2P13521 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCG2P13521 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCG2P13521 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCG2P13521 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCG2P13521 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCG2P13521 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCG2P13521 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCG2P13521 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCG2P13521 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCG2P13521 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCG2P13521 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCG2P13521 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCG2P13521 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCG2P13521 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCG2P13521 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCG2P13521 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCG2P13521 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCG2P13521 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCG2P13521 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCG2P13521 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCG2P13521 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCG2P13521 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCG2P13521 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCG2P13521 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCG2P13521 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCG2P13521 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCG2P13521 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SCG2P13521 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SCG2P13521 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCG2P13521 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCG2P13521 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCG2P13521 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCG2P13521 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCG2P13521 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCG2P13521 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCG2P13521 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCG2P13521 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCG2P13521 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCG2P13521 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCG2P13521 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCG2P13521 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCG2P13521 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SCG2P13521 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCG2P13521 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCG2P13521 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCG2P13521 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCG2P13521 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCG2P13521 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCG2P13521 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCG2P13521 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SCG2P13521 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCG2P13521 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCG2P13521 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCG2P13521 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCG2P13521 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCG2P13521 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SCG2P13521 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SCG2P13521 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SCG2P13521 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCG2P13521 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCG2P13521 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCG2P13521 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCG2P13521 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCG2P13521 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCG2P13521 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCG2P13521 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SCG2P13521 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCG2P13521 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCG2P13521 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCG2P13521 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCG2P13521 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCG2P13521 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCG2P13521 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCG2P13521 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCG2P13521 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCG2P13521 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCG2P13521 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCG2P13521 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCG2P13521 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCG2P13521 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms