Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL4P12829 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYL4P12829 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYL4P12829 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MYL4P12829 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYL4P12829 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYL4P12829 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYL4P12829 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MYL4P12829 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYL4P12829 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYL4P12829 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYL4P12829 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYL4P12829 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYL4P12829 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYL4P12829 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYL4P12829 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYL4P12829 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYL4P12829 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYL4P12829 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MYL4P12829 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYL4P12829 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYL4P12829 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYL4P12829 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MYL4P12829 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYL4P12829 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL4P12829 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL4P12829 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL4P12829 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL4P12829 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL4P12829 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL4P12829 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL4P12829 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL4P12829 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL4P12829 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL4P12829 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL4P12829 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYL4P12829 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYL4P12829 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYL4P12829 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYL4P12829 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYL4P12829 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYL4P12829 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYL4P12829 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL4P12829 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL4P12829 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL4P12829 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL4P12829 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL4P12829 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL4P12829 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL4P12829 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL4P12829 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL4P12829 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL4P12829 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL4P12829 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL4P12829 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL4P12829 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYL4P12829 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYL4P12829 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MYL4P12829 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MYL4P12829 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MYL4P12829 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MYL4P12829 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYL4P12829 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MYL4P12829 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MYL4P12829 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL4P12829 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL4P12829 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL4P12829 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL4P12829 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL4P12829 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL4P12829 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL4P12829 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL4P12829 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL4P12829 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYL4P12829 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYL4P12829 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYL4P12829 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYL4P12829 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYL4P12829 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYL4P12829 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYL4P12829 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYL4P12829 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYL4P12829 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYL4P12829 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYL4P12829 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL4P12829 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL4P12829 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL4P12829 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL4P12829 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL4P12829 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL4P12829 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL4P12829 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL4P12829 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL4P12829 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL4P12829 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MYL4P12829 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL4P12829 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL4P12829 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL4P12829 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL4P12829 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms