Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chrm1P12657 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chrm1P12657 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrm1P12657 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrm1P12657 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms