Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Timp1P12032 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timp1P12032 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timp1P12032 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timp1P12032 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Timp1P12032 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Timp1P12032 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Timp1P12032 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Timp1P12032 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Timp1P12032 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timp1P12032 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timp1P12032 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timp1P12032 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Timp1P12032 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Timp1P12032 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Timp1P12032 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Timp1P12032 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms