Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FlgP11088 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FlgP11088 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FlgP11088 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FlgP11088 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FlgP11088 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FlgP11088 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FlgP11088 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FlgP11088 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FlgP11088 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FlgP11088 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FlgP11088 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FlgP11088 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FlgP11088 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FlgP11088 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FlgP11088 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FlgP11088 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FlgP11088 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FlgP11088 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FlgP11088 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FlgP11088 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FlgP11088 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FlgP11088 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FlgP11088 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FlgP11088 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FlgP11088 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FlgP11088 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FlgP11088 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FlgP11088 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FlgP11088 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FlgP11088 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FlgP11088 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FlgP11088 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FlgP11088 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FlgP11088 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FlgP11088 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FlgP11088 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FlgP11088 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FlgP11088 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FlgP11088 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FlgP11088 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FlgP11088 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FlgP11088 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FlgP11088 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FlgP11088 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FlgP11088 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FlgP11088 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FlgP11088 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FlgP11088 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FlgP11088 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FlgP11088 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FlgP11088 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FlgP11088 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FlgP11088 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FlgP11088 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FlgP11088 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FlgP11088 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FlgP11088 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FlgP11088 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FlgP11088 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FlgP11088 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FlgP11088 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FlgP11088 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FlgP11088 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FlgP11088 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FlgP11088 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FlgP11088 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FlgP11088 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FlgP11088 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FlgP11088 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FlgP11088 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FlgP11088 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FlgP11088 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FlgP11088 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FlgP11088 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FlgP11088 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FlgP11088 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FlgP11088 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FlgP11088 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FlgP11088 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FlgP11088 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FlgP11088 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FlgP11088 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FlgP11088 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FlgP11088 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FlgP11088 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FlgP11088 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FlgP11088 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FlgP11088 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FlgP11088 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FlgP11088 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FlgP11088 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FlgP11088 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FlgP11088 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FlgP11088 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FlgP11088 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FlgP11088 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FlgP11088 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FlgP11088 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FlgP11088 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms