Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN8OSP0DMR3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms