Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SAA2P0DJI9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAA2P0DJI9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SAA2P0DJI9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SAA2P0DJI9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAA2P0DJI9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAA2P0DJI9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms