Protein–RNA interactions for Protein: P0C242

Ccno, Cyclin-O, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnoP0C242 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CcnoP0C242 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CcnoP0C242 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CcnoP0C242 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms