Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxb3P09026 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb3P09026 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms