Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPP08247 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPP08247 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPP08247 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPP08247 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPP08247 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPP08247 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPP08247 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPP08247 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPP08247 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPP08247 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPP08247 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPP08247 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPP08247 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPP08247 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPP08247 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPP08247 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPP08247 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPP08247 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYPP08247 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYPP08247 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYPP08247 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYPP08247 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYPP08247 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYPP08247 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYPP08247 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYPP08247 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYPP08247 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYPP08247 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYPP08247 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYPP08247 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYPP08247 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYPP08247 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYPP08247 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYPP08247 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYPP08247 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYPP08247 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYPP08247 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYPP08247 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYPP08247 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPP08247 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPP08247 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPP08247 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPP08247 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPP08247 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPP08247 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPP08247 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPP08247 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPP08247 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPP08247 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPP08247 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPP08247 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPP08247 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPP08247 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPP08247 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPP08247 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPP08247 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPP08247 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPP08247 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPP08247 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPP08247 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPP08247 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPP08247 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPP08247 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPP08247 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPP08247 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPP08247 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPP08247 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYPP08247 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYPP08247 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYPP08247 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYPP08247 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYPP08247 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYPP08247 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYPP08247 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYPP08247 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYPP08247 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYPP08247 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYPP08247 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPP08247 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPP08247 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPP08247 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPP08247 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPP08247 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPP08247 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPP08247 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPP08247 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPP08247 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPP08247 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPP08247 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPP08247 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPP08247 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPP08247 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPP08247 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPP08247 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPP08247 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPP08247 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYPP08247 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYPP08247 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYPP08247 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138 ms