Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC3A2P08195 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC3A2P08195 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC3A2P08195 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms