Protein–RNA interactions for Protein: P07742

Rrm1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm1P07742 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrm1P07742 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrm1P07742 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rrm1P07742 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrm1P07742 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrm1P07742 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrm1P07742 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrm1P07742 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrm1P07742 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrm1P07742 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrm1P07742 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrm1P07742 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrm1P07742 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrm1P07742 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrm1P07742 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrm1P07742 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrm1P07742 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrm1P07742 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrm1P07742 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms