Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APODP05090 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APODP05090 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APODP05090 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APODP05090 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APODP05090 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APODP05090 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APODP05090 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APODP05090 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APODP05090 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APODP05090 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APODP05090 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APODP05090 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APODP05090 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APODP05090 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APODP05090 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APODP05090 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APODP05090 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APODP05090 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APODP05090 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APODP05090 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APODP05090 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APODP05090 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APODP05090 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APODP05090 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APODP05090 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APODP05090 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APODP05090 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APODP05090 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APODP05090 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APODP05090 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APODP05090 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APODP05090 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APODP05090 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APODP05090 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APODP05090 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APODP05090 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APODP05090 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APODP05090 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APODP05090 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APODP05090 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APODP05090 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APODP05090 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APODP05090 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APODP05090 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APODP05090 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APODP05090 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APODP05090 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APODP05090 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APODP05090 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APODP05090 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APODP05090 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APODP05090 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APODP05090 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APODP05090 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APODP05090 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APODP05090 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APODP05090 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APODP05090 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APODP05090 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APODP05090 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APODP05090 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APODP05090 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APODP05090 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APODP05090 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APODP05090 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APODP05090 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APODP05090 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APODP05090 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APODP05090 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APODP05090 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APODP05090 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APODP05090 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APODP05090 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APODP05090 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APODP05090 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APODP05090 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APODP05090 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APODP05090 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APODP05090 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APODP05090 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APODP05090 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APODP05090 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APODP05090 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APODP05090 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APODP05090 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APODP05090 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APODP05090 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APODP05090 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APODP05090 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APODP05090 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APODP05090 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APODP05090 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APODP05090 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APODP05090 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APODP05090 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APODP05090 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APODP05090 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APODP05090 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APODP05090 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms