Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P01746 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P01746 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P01746 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P01746 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P01746 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
P01746 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
P01746 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P01746 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P01746 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P01746 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
P01746 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P01746 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
P01746 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
P01746 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P01746 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
P01746 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
P01746 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
P01746 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
P01746 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
P01746 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
P01746 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
P01746 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
P01746 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
P01746 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
P01746 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
P01746 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
P01746 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
P01746 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
P01746 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
P01746 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
P01746 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
P01746 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P01746 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P01746 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P01746 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P01746 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P01746 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P01746 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P01746 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P01746 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
P01746 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
P01746 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
P01746 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
P01746 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
P01746 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
P01746 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
P01746 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
P01746 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
P01746 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
P01746 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
P01746 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P01746 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P01746 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P01746 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
P01746 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P01746 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P01746 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
P01746 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
P01746 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
P01746 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
P01746 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P01746 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P01746 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
P01746 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P01746 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
P01746 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P01746 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
P01746 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P01746 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P01746 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P01746 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P01746 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P01746 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P01746 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
P01746 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
P01746 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
P01746 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P01746 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P01746 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P01746 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
P01746 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P01746 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
P01746 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
P01746 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P01746 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P01746 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P01746 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P01746 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01746 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01746 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01746 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
P01746 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01746 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01746 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01746 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01746 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01746 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01746 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01746 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms