Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01738 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01738 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01738 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01738 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01738 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01738 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01738 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01738 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01738 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01738 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01738 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01738 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01738 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01738 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01738 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01738 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01738 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01738 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01738 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01738 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01738 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01738 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01738 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01738 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01738 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01738 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01738 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01738 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01738 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01738 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01738 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01738 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01738 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01738 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01738 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01738 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01738 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01738 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01738 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01738 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01738 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01738 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01738 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01738 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01738 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01738 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01738 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01738 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01738 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01738 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01738 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01738 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01738 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01738 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01738 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01738 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01738 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01738 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01738 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01738 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01738 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01738 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01738 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01738 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01738 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01738 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01738 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01738 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01738 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01738 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01738 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01738 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01738 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01738 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01738 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01738 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01738 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01738 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01738 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01738 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01738 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01738 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms